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第一百八十三章 老裘你的病有救啦5 4K（第3页）

徐云所说的16s相似度检测，指的是核糖体小亚基的rna组分检测。

也就是16srrna。

这部分长度大约1500nt，不同物种略有差异，算是目前主流的九大新物检测步骤之一。

五分钟后。

裘生抬起头，对徐云道：

“老徐，准备好了，引物你觉得用啥？”

徐云想了想，很快道：

“1492r吧。”

“好嘞！”

半个小时后。

裘生抬起头，打了个响指：

“搞定，扩出来了，blast的密匙你有吧？”

徐云朝他竖起一根大拇指示意干得漂亮，随后走到操作台边，噼里啪啦的输了一大串密匙。

做过新种检测的同学应该都知道。

16s相似度检测的界限其实有些模糊，因为不同分类群的检测相似度阈值是不一样的。

比如有的是97%，有的是99%。

只是在通常情况下。

相似度超过97%的，就可以认为是一个物种。

相似度低于97%的，就可以认为是不同物种，进行下一阶段检测。

不过就是这样一种不太精细的检测手段，却依旧是很多新物检测迈不过去的一道坎：

大部分样本在经过检测之后，都会发现相似度在99.99%以上，与其他某某微生物是同一物种。

总而言之。

这项技术在定属方面还是靠谱的。

又过了一会儿。

裘生一脸惊喜的抬起头，声音骤然拔高了几分：

“老徐，相似度46.9%，46.9%！！”

“毫无疑问，这是一类新物！”

徐云认真的看了他一眼，确认道：

“只有一种新物吗？”

“没错，只有一种！”

徐云若有所思的点点头，又道：

“那就继续上磷脂脂肪酸和呼吸醌鉴定吧。”

众所周知。

新物鉴定一般都有九个流程：

1、16s相似度。

2、形态学观察。

比如这个菌的形状、大小、鞭毛情况等等，还包括最适生长条件的确定。

3、磷脂脂肪酸鉴定，这个具有属特异性。

4、呼吸醌，也就是看一下占优势的呼吸醌是哪种，这个有种特异性。

5、分子杂交，也就是测定基因组序列，草图就行，然后跟近源物种去比较。

相似度超过70%是一个种，低于70%是不同物种。

6、碳源利用情况，看一下能利用哪些碳源，一共有95种碳源的测试。

7、api试剂盒鉴定，生理生化鉴定的一方面。

8、gc含量。